بررسی اپی توپ های خطی ایمونوژن ایمونوگلوبولین G انسان به روش ایمونوانفورماتیک

Authors

  • روحانی, سهیلا دانشگاه شاهد
  • سفید, فاطمه دانشگاه شاهد
Abstract:

  Background and objective : Immunoglobulin G (IgG) is the most abundant antibody in serum and extracellular fluids. The amount of serum IgG is associated to severity of some diseases like immunodeficiency, infections and autoimmunity. Therefore IgG has a high diagnostic value. Immunoinformatic is a branch of immunology which helps in solving of immunologic problems, well understanding of immune responses and precise diagnosis of diseases using the computational biology. The aim of this study is epitope mapping of human IgG by immunoinformatic approaches.   Methods of study : The amino acid sequence and third structure of reference human IgG was found in PDB database. The second IgG structure was determined by Phyre 2 software. IgG linear epitopes were determined by Ellipro and IEDB softwares.   Results: Linear epitopes are located in 160 - 175 and in 350 – 360 amino acid sequence of light and heavy chains respectively as was determined by IEDB software. 11 linear epitopes in constant domains of human IgG, one in fragment of antigen binding (Fab) and others in fragment of crystalizable (Fc) region (equally distributed in the second and third domains of IgG heavy chain constant region (CH2 and CH3) were determined by Ellipro. 5 main epitope are located in CH3 domain.   Conclusion: In this study a lot of linear epitopes located on human IgG were determined by two softwares and the results of previous experimental studies confirm our results. These epitopes are useful tools for producing specific monoclonal anti IgG antibodies, epitope mapping of human IgG and phylogenic studies.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی اپی توپ های خطی ایمونوژن ایمونوگلوبولین g انسان به روش ایمونوانفورماتیک

سابقه و هدف: ایمونوگلوبولین g (igg) فراوانترین آنتی بادی سرم و مایعات خارج سلولی بوده و سطح igg سرم با شدت بیماریهایی مثل نقائص ایمنی، عفونتها و بیماریهای خود ایمنی ارتباط دارد. لذا igg ارزش تشخیصی بالایی دارد. ایمونوانفورماتیک، شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با استفاده از اطلاعات زیستی در کامپیوتر به حل مسائل ایمونولوژیک، فهم بهتر پاسخهای ایمنی وتشخیص دقیق تر بیماریها کمک می کند. این پژوهش ب...

full text

تعیین اپی توپ های ناپیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونولوژی محاسبه ای

Background: Immunoglobulins are a group of proteins that have important role in defense against microorganisms. Immunoglobulins consist of heavy and light chains. In human, immunoglobulin light chain comprises of two isotypes: Kappa (K) and lambda (λ) based on amino acid differences in carboxylic end of their constant region. Marked changes in the K to λ ratio can happen in monocl...

full text

ایمونوانفورماتیک و روش های پیشگویی اپی توپ، دانشی پویا با دستاوردهای امیدبخش

روش های نوین ایمونوانفورماتیک راهبردهای تازه ای را جهت شناسایی، طراحی و ساخت اپی توپ های اختصاصی آنتی ژن جهت استفاده در مقاصد گوناگون نظیر؛ واکسن ها، آلرژی ها، ایمنی درمانی و غیره فراهم آورده است. الگوهای تازه در طراحی واکسن ها، شناسایی آلرژن ها و ایمنی درمانی به واسطه اکتشافات مهم در علم ایمنی شناسی و توسعه ابزارها و الگوریتم های پیشگویی اپی توپ های سلول B و T، به نظر امری ضروری است. در این مق...

full text

ایمونوانفورماتیک و روش های پیشگویی اپی توپ، دانشی پویا با دستاوردهای امیدبخش

روش های نوین ایمونوانفورماتیک راهبردهای تازه ای را جهت شناسایی، طراحی و ساخت اپی توپ های اختصاصی آنتی ژن جهت استفاده در مقاصد گوناگون نظیر؛ واکسن ها، آلرژی ها، ایمنی درمانی و غیره فراهم آورده است. الگوهای تازه در طراحی واکسن ها، شناسایی آلرژن ها و ایمنی درمانی به واسطه اکتشافات مهم در علم ایمنی شناسی و توسعه ابزارها و الگوریتم های پیشگویی اپی توپ های سلول b و t، به نظر امری ضروری است. در این مق...

full text

مدل‌سازی ایمونوانفورماتیکی، ساخت پلاسمیدهای حامل اپی‌توپ‌های CTL ویروس هپاتیت C و بررسی اولیه ایمنی‌زایی آنها

زمینه و اهداف: تاثیرات سرکوب کنندگی برخی از کلیدی ترین پروتئین‌های ویروس هپاتیت c بر سیستم ایمنی و جهش سریع ویروس، توجه را به واحدهای ایمونوژن کوچک و پایدار جلب نمود. لذا، واکسن های مولتی اپی توپ به منظور تمرکز پاسخ ایمنی بر این واحدها معرفی شدند. ولی، به دلیل پاسخ ایمنی نسبتاً ضعیف علیه این واکسن ها، افزایش ایمنی زایی نیازمند تمهیدات بیشتری است. این مطالعه با هدف ساخت پلاسمیدهای حامل اپی‌توپ...

full text

ایمونوانفورماتیک: نگاهی نو در فهم عملکرد سیستم ایمنی، پایگاه های داده و پیش گویی اپی توپ های ایمونوژنیک

سابقه و هدف: ایمونوانفورماتیک یا ایمونولوژی محاسباتی اخیراً به عنوان زمینه ای مهم و نوین نقش چشمگیری را در علوم آنالیز، مدل سازی و پیشگویی عمل کرد سیستم ایمنی، طراحی واکسن های جدید، تحقیقات آلرژی زایی و اکتشافات دارویی داشته است. این علم نه تنها سبب تسریع تحقیقات علمی شده بلکه به علت تعامل آن با پروژه های ژنوم منجر به دست یابی به اطلاعات بسیار زیادی در ارتباط با ایمنی شناسی گردیده است. در واقع ا...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 40  issue 1

pages  30- 35

publication date 2016-05

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023